基地以自然与环境科学教育为主题，依托科研力量雄厚的植物所，推进科普工作理念和模式创新，深入开展公众科学教育活动，为提升公民科学素养贡献力量。植物所通过加强科普基地、科普队伍、科普活动、科普产品和科普平台建设，形成了体系化的科普工作模式和明确的科普理念——幽静中休闲、体验中学习、探索中成长、自然中感悟。
植物所包括2个国家重点实验室、3个中国科学院重点实验室、1个公共技术服务中心，可提供重点实验室参观、理论知识与背景讲解、课题设计、实验与答辩完整的科学教育活动等。
以植物所北京植物园（15个专类植物展区、1个热带植物展览温室、科普实践中心、科普展示中心）和国家植物标本馆（亚洲最大的植物标本馆，馆藏280万余份植物标本、7万份化石标本、8万份种子标本）为基础，可开展植物识别、标本制作、种植体验、科学绘画、自然笔记等自然教育体验活动和劳动教育等。
植物所所属8个野外台站（内蒙古锡林郭勒草原生态系统国家野外科学观测研究站、内蒙古鄂尔多斯草地生态系统国家野外科学观测研究站等），可进行中学生野外科学考察课题研究。
植物所每年都举办特色科普展览，牡丹科技文化展、千年古莲展、活体罂粟禁毒展、科学家精神展等。
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